Biochemische Darstellung funktionaler Proteome und großer Proteinkomplexe

Proteine leisten den entscheidenden Beitrag zur Struktur und
Funktion der Zellen aller Lebewesen.Vieles spricht daher für eine
Betrachtung des Proteoms oder einer Teilmenge davon (Subproteom),
um den Zustand lebender Zellen zu beschreiben. Mit optimierten und
neuen Methoden wurde das regulatorische Netzwerk, welches auf der
Ebene der Trankription die Expression von Proteinen entscheidend
mitbestimmt, genauer betrachtet. Hierzu wurden
Zellfraktionierungsprotokolle optimiert, um die Proteine des
Zellkerns und des Chromatins anzureichern und in nachfolgenden
Analysen verwenden zu können. Es wurden Antikörper gegen
verbreitete, funktional relevante Peptidmotive generiert. Aufbauend
auf dem Konzept der Motivantikörper wurde eine Färbemethode für
Zellkernproteine mit Kernlokalisationssignal entwickelt.
Schließlich wurde mit den Methoden der Zellfraktionierung und
spezifischeren Antikörpertechniken eine Analyse des humanen
Mediator-Komplexes der RNA Polymerase II unternommen, die zur
Entdeckung neuer Untereinheiten, potentiell interagierender
Proteine und Phosphorylierungen im Komplex führte.